Анализ генетических маркеров при коморбидном течении тиреоидной патологии и метаболического синдрома

Первый Московский государственный медицинский университет им. И. М. Сеченова, г. Москва

Казахский Национальный университет им. аль-Фараби, г. Алматы, Казахстан

Казахский НИИ онкологии и радиологии, г. Алматы, Казахстан

Институт молекулярной биологии и медицины, г. Бишкек, Кыргызская Республика

Введение

На сегодняшний день многочисленные научные работы посвящены изучению генетических предикторов риска развития метаболического синдрома и аутоиммунной патологии щитовидной железы. В качестве основных маркеров исследуются такие гены как: PPARG3, кодирующего белок-рецептор, активируемый пролифератором пероксисом типа ɣ3 - однонуклеотидная замена C(-681)G (rs10865710), в гене ADRB2, кодирующем бета-2-адренергический рецептор - мутация Arg 16/Gly (rs 1042713), и однонуклеотидная замена T(-47)C (rs1042711) [1]. Кроме того, для гена GNB3, кодирующего гуанин нуклеотидсвязывающий белок бета-3 - синонимичная замена С825Т (rs5443) [2]. Полиморфные маркеры использовались в нашей работе для изучения ассоциации генов-кандидатов с патологией щитовидной железы и метаболическим синдромом.

Согласно, сделанным выводам полиморфный маркер Arg 16/Gly (rs 1042713) гена ADRB2 имел достоверные различия в частоте аллелей и генотипов между основной группой и группой сравнения. Это говорит об ассоциации полиморфного маркера с сочетанным течением у пациентов заболевания щитовидной железы с метаболическим синдромом.

Цель исследования: изучить полиморфизм генов PPARG3, PPARGC1A, ADRB2, GNB3 при тиреоидной патологии, так и при сочетанном течении с метаболическим синдромом (далее МС). 

Материалы и методы

В генетическое исследование включены 90 пациентов в возрасте от 18 лет и старше. Из них женщин 65 человек, мужчин - 25 человек.

Геномную ДНК выделяли из 50 мкл периферической крови с использованием набора «MagMax-96 DNA Multi-Sample Kit» (Applied Biosystems, США) и автоматической станции для выделения ДНК MagMax Express 96 (Applied Biosystems, США), методика с использованием магнитных твердых носителей. Выделение проводили согласно рекомендациям производителя. Определение концентрации ДНК в образцах производили на приборе «NanoDrop» (Thermo Scientific, США). Для контроля продукты амплификации визуализировались электрофорезом в агарозном геле.

Для детекции полиморфизмов генов PPARG3 (rs10865710), ADRB2 (rs1042713), ADRB2 (rs1042711), GNB3 (rs5443) использовали флуоресцентно-меченные олигонуклеотиды по технологии TaqMan. В качестве матрицы использовалось 5-10 нг геномной ДНК. Стандартные олигонуклеотиды и олигонуклеотиды, несущие 6-карбоксифлуоресцеин (FAM), карбокси-x-родамин (ROX) были синтезированы в Национальном центре биотехнологий (Астана). Выявление аллельных вариантов исследуемого гена с использованием ПЦР в режиме «реального времени» проводили с использованием термоциклера Rotor Gene (Qiagen. Германия) в 25 мкл реакционной смеси.

Относительный риск развития заболевания по аллелям и генотипам определялся как отношение шансов (OR). Отношение шансов (OR) рассчитывали по соответствующей формуле. OR=1 рассматривали как отсутствие ассоциации, OR>1 свидетельствовало о наличии предрасположенности (фактор риска), OR<1 - о предохраняющем действии (защитный фактор) генетического маркера (аллеля или генотипа) к развитию патологии. Установление соответствия выборок равновесию Харди Вайнберга проводили с использованием критерий χ2. Для диагностических тестов рассчитывалась чувствительность и специфичность по соответствующим формулам с последующим построением характеристической кривой (ROC-кривая).

Результаты исследований

Полиморфный маркер C(-681)G (rs10865710) гена PPARG3

Продукт этого гена контролирует экспрессию генов, вовлеченных в регуляцию обмена жирных кислот и адипогенез. PPARG3 влияет на метаболизм сердечной мышцы, являясь регулятором энергетического баланса, ассоциирован с повышенным индексом массы тела и распределением жировой ткани в организме, что является факторами риска для развития атеросклероза [3].

Полиморфный маркер С825Т( rs5443) гена GNB3

Ген GNB3 кодирует гуанин нуклеотидсвязывающий белок бета-3, расположен на хромосоме 12p13.31. Полиморфизм С825Т(rs5443) заключается в точечной замене основания цитозина (С) на тимин (Т) в 10-м экзоне гена GNB3 [5]. В результате альтернативного сплайсинга аллеля Т теряется 498-620 нуклеотидов в 9-м экзоне, и это приводит к синтезу укороченного белка. Активность синтезируемого G-белка меняется, что может повлечь за собой нарушения в передаче внутриклеточных сигналов и привести к сужению сосудов, гипертонии, гипертрофии левого желудочка, клеточной пролиферации и другим патологиям [2]. Ассоциирован с генетической предрасположенностью к артериальной гипертензии, гипертрофии левого желудочка, ожирению, инсулинорезистентности, сахарному диабету и его осложнениям.

Полиморфный маркер Arg 16/Gly (rs 1042713) гена ADRB2

Ген ADRB2, кодирующий бета-2-адренергический рецептор расположен на хромосоме 5q32. ADRB2 кодирует бета-2-адренергический рецептор - ионный белковый канал, встроенный в цитоплазматическую мембрану клетки, имеющий высокую степень сродства к адреналину и обеспечивающий повышение или понижение активности иннервируемой ткани или органа [4]. Этот маркер связан с особенностями работы нейронных рецепторов, ассоциирован с предрасположенностью к метаболическому синдрому, ожирению, бронхиальной астме, риску развития артериальной гипертензии у больных сахарным диабетом 2-го типа.

Полиморфный маркер T(-47)C (rs1042711) гена ADRB2

Этот полиморфный маркер представляет собой однонуклеотидную замену и находится в 5′-нетранслируемой (регуляторной) области гена ADRB2.

В нашей работе были проанализированы ассоциации полиморфных маркеров всех трех генов. Проведенный анализ данных генетических маркеров , таких как: C(-681)G (rs10865710) гена PPARG3, С825Т( rs5443) гена GNB3, T(-47)C (rs1042711) гена ADRB2 не выявил достоверных (p<0,05) различий в частотах аллелей и генотипов во всех трех сравниваемых группах (табл. 1-3).

Таблица 1. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера C(-681)G (rs10865710) гена PPARG3 (группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией щитовидной железы (далее ЩЖ), группа пациентов только с патологией ЩЖ)

Таблица 1. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера C(-681)G (rs10865710) гена PPARG3 (группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией щитовидной железы (далее ЩЖ), группа пациентов только с патологией ЩЖ)

Таблица 2. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера С825Т( rs5443) гена GNB3(группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ, группа пациентов только с патологией ЩЖ)

Таблица 2. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера С825Т( rs5443) гена GNB3(группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ, группа пациентов только с патологией ЩЖ)

Таблица 3. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера T(-47)C (rs1042711) гена ADRB2 (группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ, группа пациентов только с патологией ЩЖ)

Таблица 3. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера T(-47)C (rs1042711) гена ADRB2 (группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ, группа пациентов только с патологией ЩЖ)

Из представленных данных в таблице видно, что величины OR по сравниваемым выборкам говорят об отсутствии статистической значимости связи между наличием полиморфного маркера и развитием метаболического синдрома и\или патологии щитовидной железы, согласно оценке доверительного интервала (95% CI включает 1).

Полиморфный маркер Arg 16/Gly (rs 1042713) гена ADRB2

Ген ADRB2, кодирующий бета-2-адренергический рецептор расположен на хромосоме 5q32. ADRB2 кодирует бета-2-адренергический рецептор - ионный белковый канал, встроенный в цитоплазматическую мембрану клетки, имеющий высокую степень сродства к адреналину и обеспечивающий повышение или понижение активности иннервируемой ткани или органа [4]. Этот маркер связан с особенностями работы нейронных рецепторов, ассоциирован с предрасположенностью к метаболическому синдрому, ожирению, бронхиальной астме, риску развития артериальной гипертензии у больных сахарным диабетом 2-го типа.

Анализ данных показал достоверные различия в частоте аллелей и генотипов между группой пациентов с коморбидным течением МС и патологии ЩЖ, и группой пациентов с МС, без диагностированной патологии ЩЖ (р<0,05). Аллель А (OR=0,36; 95% CI=0,16-0,74) и генотип АА (OR=0,03; 95% CI=0,004-0,25) достоверно чаще встречались в группе с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ, чем в группе, имеющей только МС, что говорит об ассоциации полиморфного маркера с сочетанным течением у пациентов заболевания щитовидной железы с метаболическим синдромом.

Также, сравнение частот аллелей и генотипов между группой пациентов с коморбидным течением МС и патологии ЩЖ, и группой пациентов с изолированным поражением ЩЖ, показало наличие достоверных (p<0,05) различий. Аллель А (OR =4,13; 95% CI=1,9-9,17) и генотип АА (OR =69,4; 95% CI=3,9-1240), достоверно чаще встречались в группе пациентов с коморбидным течением МС и патологии ЩЖ, чем в группе пациентов с изолированным поражением ЩЖ, что говорит об ассоциации полиморфного маркера с сочетанным течением у пациентов заболевания щитовидной железы с метаболическим синдромом. Кроме того, генотип AG (OR =0,021; 95% CI=0,001-0,38) ассоциирован с заболеванием щитовидной железы без наличия метаболического синдрома. Таким образом, нами показана ассоциация аллеля А и генотипа АА полиморфного маркера Arg 16/Gly (rs 1042713) гена ADRB2 с сочетанным течением заболевания щитовидной железы с метаболическим синдромом.

Тем более что анализ данных частот аллелей и генотипов по группе пациентов, имеющих только МС и группе пациентов, у которых обнаружено только изолированное поражением ЩЖ не выявил достоверных (p<0,05) различий в частотах аллелей и генотипов между сравниваемыми выборками. Величины OR по сравниваемым выборкам также говорят об отсутствии статистической значимости связи между наличием полиморфного маркера и развитием метаболического синдрома согласно оценке доверительного интервала (95 % CI включает 1) (табл. 4).

Таблица 4. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера Arg 16/Gly (rs 1042713) гена ADRB2, группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ

Таблица 4. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера Arg 16/Gly (rs 1042713) гена ADRB2, группа пациентов с МС и группа пациентов с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ

Выводы

Статистически значимые различия обнаружены в гене ADRB2, а именно в полиморфном маркере Arg 16/Gly (rs 1042713) гена. Корреляция обнаружена между встречаемостью аллеля А (OR=0,36; 95% CI=0,16-0,74) и генотипа АА (OR=0,03; 95% CI=0,004-0,25), которые достоверно чаще встречались в группе с коморбидным течением МС и патологией ЩЖ, чем в группе, имеющей только МС, что говорит об ассоциации полиморфного маркера с сочетанным течением у пациентов заболевания щитовидной железы с метаболическим синдромом.

Список использованных источников:

1. Michalik L., Auwerx J., Berger J. P., Chatterjee V. K., Glass C. K., Gonzalez F. J., Grimaldi P. A., Kadowaki T., Lazar M. A., O’Rahilly S., Palmer C. N., Plutzky J., Reddy J. K., Spiegelman B. M., Staels B., Wahli W. International Union of Pharmacology. LXI. Peroxisome proliferator-activated receptors // Pharmacol. Rev. - 2006.-№ 58 (4). - С. 726-41.

2. Siffert W., Rosskopf D., Siffert G., Busch S., Moritz A., Erbel R., Sharma A. M., Ritz E., Wichmann H.-E., Jakobs K. H., Horsthemke, B. Association of a human G-protein beta-3 subunit variant with hypertension // Nature Genet. - 1998. - № 18. - С. 45-48.

3. Masud S., Ye S. Effect of the peroxisome proliferator-activated receptor-γ gene Pro12Ala variant on body mass index: a meta-analysis // J med genet. - 2003. - № 40. - С. 773-780.

4. Israel E. et al. The effect of polymorphisms of the beta(2)-adrenergic receptor on the response to regular use of albuterol in asthma // Am J Respir Crit Care Med. - 2000. - №162(1). - С.75-80.

5. Галиева М. О., Трошина Е. А. Роль генетических факторов в прогнозировании результатов фармакологического лечения ожирения на примере сибутрамина - ингибитора обратного захвата серотонина и норадреналина // Ожирение и метаболизм. - 2016. - №13(4). - С. 21-26.